در روزهای اول پس از پیوند، معمولاً معاینات به صورت روزانه انجام می شود. پس از یکی دو هفته غالباً فاصله معاینات به 3 تا 4 روز افزایش می یابد و به تدریج فاصله معاینات طولانی تر می شود به طوری که طی 6 ماه اول پس از انجام پیوند قرنیه هر چند هفته یکبار معاینه چشم پزشکی تکرار می شود.
 پس از 6 ماه، فواصل معاینات طولانی تر شده و به 3 تا 6 ماه می رسد. در هر معاینه، چشم پزشک بیمار را از نظر میزان دید، وضعیت بخیه ها، احتمال رد پیوند و عوارض داروها مورد معاینه و بررسی قرار می دهد.
 توجه داشته باشید پس از پیوند قرنیه حتی اگر سال ها از عمل جراحی گذشته باشد در صورت بروز هر حالت غیرطبیعی مثل کاهش دید، اشک ریزش بیش از حد، درد، احساس جسم خارجی، ترس از نور یا قرمزی چشم، بیمار باید حداکثر ظرف 24 ساعت به چشم پزشک مراجعه کند.
همچنین معمولاً بعد از انجام پیوند قرنیه لازم است تا چند هفته از قطره های آنتی بیوتیک و تا چند ماه از قطره های استروئیدی که التهاب را کنترل می کند استفاده شود. ممکن است با تشخیص چشم پزشک قطره های دیگری مثل اشک مصنوعی یا قطره های پایین آورنده فشار چشم نیز تجویز شود. بعد از عمل حتماً قطره ها را طبق دستور پزشک و به صورت دقیق مصرف کنید و از قطع کردن خودسرانه داروها پرهیز نمایید. مصرف نادرست دارو می تواند باعث از بین رفتن قرنیه پیوندی و نابینایی شود.