پس از ورود بیمار به بخش جراحی کاتاراکت ، چشم بیمار توسط قطره ‌های مخصوص بی ‌حس می‌ گردد؛ در این مرحله ممکن است از داروهای آرام ‌بخش نیز استفاده شود. پوست اطراف چشم به دقت تمیز شده و یک پوشش استریل روی سر و صورت قرار می‌ گیرد.
در حین عمل آب مروارید ممکن است بیمار نور و حرکت را ببیند، اما قادر به دیدن و درک مراحل جراحی نیست. جراح در نخستین اقدام با استفاده از میکروسکوپ جراحی آب مروارید برش کوچکی در سطح چشم ایجاد می کند. در اغلب عمل های جراحی کاتاراکت چشم از یک وسیله ظریف به نام ماشین فیکو برای برداشتن عدسی کدر شده استفاده می‌ شود. معمولاً غشای خلفی عدسی چشم (به نام کپسول خلفی) در محل باقی می‌ ماند و یک عدسی داخل چشمی از جنس سیلیکون، آکریلیک و یا پلاستیک جایگزین عدسی کدر شده می شود. بعد از اتمام عمل آب مروارید معمولاً چشم پزشک یک پوشش محافظ بر روی چشم بیمار قرار می ‌دهد و بعد از یک استراحت کوتاه مدت در بخش، بیمار می ‌تواند به منزل برود.
در عمل کاتاراکت چشم دو طرفه، با نظر چشم پزشک بین عمل دو چشم یک تا سه هفته فاصله در نظر گرفته می شود.